Basic bioinformatics and genomics

  • Unterricht

    Details

    Fakultät Math.-Nat. und Med. Fakultät
    Bereich Biochemie
    Code UE-SBC.07004
    Sprachen Englisch
    Art der Unterrichtseinheit Übung
    Vorlesung
    Kursus Bachelor
    Semester SA-2022

    Titel

    Französisch Bioinformatique et génomique de base
    Deutsch Grundlagen der Bioinformatik und Genomik
    Englisch Basic bioinformatics and genomics

    Zeitplan und Räume

    Vorlesungszeiten Freitag , Blockkurs (Herbstsemester)
    Strukturpläne weekly lecture 12 hours + exercises 12h
    Kontaktstunden 24

    Unterricht

    Verantwortliche
    • Falquet Laurent
    Dozenten-innen
    • Falquet Laurent
    Beschreibung

    Die Kenntnis der Grundlagen über die Entstehung und Bearbeitung von biologischen Sequenzdaten ist ein Muss für jeden biomedizinischen Forscher. Dieser Kurs ist auf zwei Hauptrichtungen ausgerichtet. Zum einen werden die grundlegenden Konzepte von DNA- und Proteinsequenzdatenbanken und die Analyse mit Hilfe von Bioinformatikwerkzeugen (paarweise Alignments, Dotplots, multiple Sequenzalignments, Suche in Datenbanken mit Sequenzen, Sequenzmotiven oder Hidden-Markov-Modellen) vorgestellt. Zweitens werden Konzepte der Genomik wie die Sequenzierungstechnologien, das Humangenomprojekt und die Genombrowser vorgestellt.

     

    Jede Woche wird ein Hauptkonzept detailliert behandelt, wobei die Algorithmen der wichtigsten Methoden mit einem besonderen Blick auf ihre Vor- und Nachteile erklärt werden. Jede Woche werden praktische Übungen durchgeführt, die direkt mit den theoretischen Vorlesungen verbunden sind, um das Lernen durch den Einsatz einfacher Web-Tools zu verstärken.

     

    Bemerkungen

    Attention: ne peut pas être pris conjointement à SBC.07003

    La présence aux sessions d'exercices est recommandée.

    Soft Skills Nein
    ausserhalb des Bereichs Ja
    BeNeFri Ja
    Mobilität Ja
    UniPop Nein
  • Einzeltermine und Räume
    Datum Zeit Art der Unterrichtseinheit Ort
    23.09.2022 10:15 - 12:00 Kurs PER 21, Raum E140
    23.09.2022 13:15 - 15:00 Kurs PER 21, Raum E140
    27.09.2022 10:15 - 12:00 Kurs PER 21, Raum C140
    30.09.2022 13:15 - 15:00 Kurs PER 21, Raum E140
    04.10.2022 10:15 - 12:00 Kurs PER 21, Raum C140
    07.10.2022 13:15 - 15:00 Kurs PER 21, Raum E140
    11.10.2022 10:15 - 12:00 Kurs PER 21, Raum C140
    14.10.2022 13:15 - 15:00 Kurs PER 21, Raum E140
    18.10.2022 10:15 - 12:00 Kurs PER 21, Raum C140
    21.10.2022 13:15 - 15:00 Kurs PER 21, Raum E140
    25.10.2022 10:15 - 12:00 Kurs PER 21, Raum C140
    28.10.2022 13:15 - 15:00 Kurs PER 21, Raum E140
  • Leistungskontrolle

    Schriftliche Prüfung - SA-2022, Wintersession 2023

    Datum 16.02.2023 08:15 - 08:45
    Bewertungsmodus Nach Note
    Beschreibung

    Epreuve écrite (30 minutes). Une note est attribuée.

    Schriftliche Prüfung - SP-2023, Herbstsession 2023

    Bewertungsmodus Nach Note
    Beschreibung

    Epreuve écrite (30 minutes). Une note est attribuée.

  • Zuordnung
    Zählt für die folgenden Studienpläne:
    Biochemie [3e cycle]
    Version: 2015_1/V_01
    Weiterbildung > Fortgeschrittene UE in Biochemie (Niveau Bachelor)

    Biochemie [POST-DOC]
    Version: 2015_1/V_01
    Weiterbildung > Fortgeschrittene UE in Biochemie (Niveau Bachelor)

    Biologie 120
    Version: 2023_1/V_01
    BSc in Biologie, Hauptfach, 2.-3. Jahr - Moleküle und Praktika > BSc in Biologie, Hauptfach, 2.-3. Jahr - Moleküle und Praktika (ab HS2023)

    Ergänzende Lehrveranstaltungen in Naturwissenschaften
    Version: ens_compl_sciences
    Paquet indépendant des branches > Fortgeschrittene UE in Biochemie (Niveau Bachelor)

    Vorstufe zum MSc in Bioinformatik und computationale Biologie [PRE-MA]
    Version: 2022_1/V_01
    Vorstufe zum MSc in Bioinformtics and Computational Biology > Fortgeschrittene UE in Biochemie (Niveau Bachelor)

    Vorstufe zum MSc in Biology [PRE-MA]
    Version: 2022_1/V_01
    Vorstufe zum MSc in Biologie > Fortgeschrittene UE in Biochemie (Niveau Bachelor)

    Zusatz zum MSc in Bioinformatics and Computational Biology [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    Zusatz zum MSc in Bioinformatics and Computational Biology > Fortgeschrittene UE in Biochemie (Niveau Bachelor)

    Zusatz zum MSc in Biology [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    Zusatz zum MSc in Biologie > Fortgeschrittene UE in Biochemie (Niveau Bachelor)