Basic bioinformatics and genomics

  • Enseignement

    Détails

    Faculté Faculté des sciences et de médecine
    Domaine Biochimie
    Code UE-SBC.07004
    Langues Anglais
    Type d'enseignement Cours
    Exercice
    Cursus Bachelor
    Semestre(s) SA-2022

    Titre

    Français Bioinformatique et génomique de base
    Allemand Grundlagen der Bioinformatik und Genomik
    Anglais Basic bioinformatics and genomics

    Horaires et salles

    Horaire résumé (Semestre d'automne)
    Struct. des horaires weekly lecture 12 hours + exercises 12h
    Heures de contact
    		24

    Enseignement

    Responsables
    • Falquet Laurent
    Enseignant·e·s
    • Falquet Laurent
    Description

    La connaissance de base sur les origines et les manipulations des données de séquences biologiques est un must pour tout chercheur biomédical. Ce cours est orienté dans deux directions principales. Premièrement, il présente les concepts de base permettant la compréhension des bases de données de séquences d'ADN et de protéines et leur analyse à l'aide d'outils bioinformatiques (alignements par paires, dotplots, alignements de séquences multiples, recherche de séquences dans les bases de données, motifs de séquences ou modèles de Markov cachés). Ensuite, il introduit des concepts de génomique tels que les technologies de séquençage, le projet du génome humain et les navigateurs de génome. Chaque semaine, un concept principal est détaillé, expliquant les algorithmes des méthodes les plus importantes avec un regard particulier sur leurs avantages et inconvénients. Chaque semaine, des exercices pratiques directement liés aux cours théoriques sont utilisés pour renforcer l'apprentissage en s'appuyant sur des outils web simples.
    Commentaire

    Attention: ne peut pas être pris conjointement à SBC.07003

    La présence aux sessions d'exercices est recommandée.
    Softskills Non
    Hors domaine Oui
    BeNeFri Oui
    Mobilité Oui
    UniPop Non
  • Dates et salles
    Date Heure Type d'enseignement Lieu
    23.09.2022 10:15 - 12:00 Cours PER 21, salle E140
    23.09.2022 13:15 - 15:00 Cours PER 21, salle E140
    27.09.2022 10:15 - 12:00 Cours PER 21, salle C140
    30.09.2022 13:15 - 15:00 Cours PER 21, salle E140
    04.10.2022 10:15 - 12:00 Cours PER 21, salle C140
    07.10.2022 13:15 - 15:00 Cours PER 21, salle E140
    11.10.2022 10:15 - 12:00 Cours PER 21, salle C140
    14.10.2022 13:15 - 15:00 Cours PER 21, salle E140
    18.10.2022 10:15 - 12:00 Cours PER 21, salle C140
    21.10.2022 13:15 - 15:00 Cours PER 21, salle E140
    25.10.2022 10:15 - 12:00 Cours PER 21, salle C140
    28.10.2022 13:15 - 15:00 Cours PER 21, salle E140
  • Modalités d'évaluation

    Examen écrit - SA-2022, Session d'hiver 2023

    Date 16.02.2023 08:15 - 08:45
    Mode d'évaluation Par note
    Description

    Epreuve écrite (30 minutes). Une note est attribuée.

    Examen écrit - SP-2023, Session d'automne 2023

    Mode d'évaluation Par note
    Description

    Epreuve écrite (30 minutes). Une note est attribuée.
  • Affiliation
    Valable pour les plans d'études suivants:
    Biochimie [POST-DOC]
    Version: 2015_1/V_01
    Formation continue > UE avancées en Biochimie (niveau bachelor)
    Biologie 120
    Version: 2025_1/V_01
    BSc en biologie, branche principale, 2-3ème années - Molécules et travaux pratiques > BSc en biologie, branche principale, 2-3ème années - Molécules et travaux pratiques (dès SA2025)
    Complément au MSc in Bioinformatics and Computational Biology [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    Complément au MSc in Bioinformatics and Computational Biology > UE avancées en Biochimie (niveau bachelor)
    Complément au MSc in Biology [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    Complément au MSc en biologie > UE avancées en Biochimie (niveau bachelor)
    Enseignement complémentaire en sciences
    Version: ens_compl_sciences
    Paquet indépendant des branches > UE avancées en Biochimie (niveau bachelor)
    Préalable au MSc en Bioinformatique et biologie computationnelle [PRE-MA]
    Version: 2022_1/V_01
    Préalable au MSc in Bioinformatics and Computational Biology > UE avancées en Biochimie (niveau bachelor)
    Préalable au MSc in Biology [PRE-MA]
    Version: 2022_1/V_01
    Préalable au MSc en biologie > UE avancées en Biochimie (niveau bachelor)