Basic bioinformatics and genomics
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Enseignement
Détails
Faculté Faculté des sciences et de médecine Domaine Biochimie Code UE-SBC.07004 Langues Anglais Type d'enseignement Exercice
Cours
Cursus Bachelor Semestre(s) SA-2022 Titre
Français Bioinformatique et génomique de base Allemand Grundlagen der Bioinformatik und Genomik Anglais Basic bioinformatics and genomics Horaires et salles
Horaire résumé Vendredi , Cours bloc (Semestre d'automne)
Struct. des horaires weekly lecture 12 hours + exercises 12h Heures de contact 24 Enseignement
Responsables Enseignants Description La connaissance de base sur les origines et les manipulations des données de séquences biologiques est un must pour tout chercheur biomédical. Ce cours est orienté dans deux directions principales. Premièrement, il présente les concepts de base permettant la compréhension des bases de données de séquences d'ADN et de protéines et leur analyse à l'aide d'outils bioinformatiques (alignements par paires, dotplots, alignements de séquences multiples, recherche de séquences dans les bases de données, motifs de séquences ou modèles de Markov cachés). Ensuite, il introduit des concepts de génomique tels que les technologies de séquençage, le projet du génome humain et les navigateurs de génome. Chaque semaine, un concept principal est détaillé, expliquant les algorithmes des méthodes les plus importantes avec un regard particulier sur leurs avantages et inconvénients. Chaque semaine, des exercices pratiques directement liés aux cours théoriques sont utilisés pour renforcer l'apprentissage en s'appuyant sur des outils web simples.
Commentaire Attention: ne peut pas être pris conjointement à SBC.07003
La présence aux sessions d'exercices est recommandée.
Softskills Non Hors domaine Oui BeNeFri Oui Mobilité Oui UniPop Non -
Dates et salles
Date Heure Type d'enseignement Lieu 23.09.2022 10:15 - 12:00 Cours PER 21, salle E140 23.09.2022 13:15 - 15:00 Cours PER 21, salle E140 27.09.2022 10:15 - 12:00 Cours PER 21, salle C140 30.09.2022 13:15 - 15:00 Cours PER 21, salle E140 04.10.2022 10:15 - 12:00 Cours PER 21, salle C140 07.10.2022 13:15 - 15:00 Cours PER 21, salle E140 11.10.2022 10:15 - 12:00 Cours PER 21, salle C140 14.10.2022 13:15 - 15:00 Cours PER 21, salle E140 18.10.2022 10:15 - 12:00 Cours PER 21, salle C140 21.10.2022 13:15 - 15:00 Cours PER 21, salle E140 25.10.2022 10:15 - 12:00 Cours PER 21, salle C140 28.10.2022 13:15 - 15:00 Cours PER 21, salle E140 -
Modalités d'évaluation
Examen écrit - SA-2022, Session d'hiver 2023
Date 16.02.2023 08:15 - 08:45 Mode d'évaluation Par note Description Epreuve écrite (30 minutes). Une note est attribuée.
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Affiliation
Valable pour les plans d'études suivants: Biochimie [3e cycle]
Version: 2015_1/V_01
Formation continue > UE avancées en Biochimie (niveau bachelor)
Biochimie [POST-DOC]
Version: 2015_1/V_01
Formation continue > UE avancées en Biochimie (niveau bachelor)
Biologie 120
Version: 2022_1/V_01
BSc en biologie, branche principale, 2-3ème années > BSc en biologie, branche principale, 2-3ème années (dès SA2022)
Complément au MSc in Bioinformatics and Computational Biology [MA]
Version: 2022_1/V_01
Complément au MSc in Bioinformatics and Computational Biology > UE avancées en Biochimie (niveau bachelor)
Complément au MSc in Biology [MA]
Version: 2022_1/V_01
Complément au MSc en biologie > UE avancées en Biochimie (niveau bachelor)
Enseignement complémentaire en sciences
Version: ens_compl_sciences
Paquet indépendant des branches > UE avancées en Biochimie (niveau bachelor)
Préalable au Bioinformatique et biologie computationnelle [PRE-MA]
Version: 2022_1/V_01
Préalable au MSc in Bioinformtics and Computational Biology > UE avancées en Biochimie (niveau bachelor)
Préalable au MSc in Biology [PRE-MA]
Version: 2022_1/V_01
Préalable au MSc en biologie > UE avancées en Biochimie (niveau bachelor)