Metagenomics data analysis

  • Unterricht

    Details

    Fakultät Math.-Nat. und Med. Fakultät
    Bereich Biologie
    Code UE-SBL.00425
    Sprachen Englisch
    Art der Unterrichtseinheit Vorlesung
    Kursus Master
    Semester FS-2023

    Titel

    Französisch Analyse de données métagénomiques
    Deutsch Analyse von Metagenomischen Daten
    Englisch Metagenomics data analysis

    Zeitplan und Räume

    Vorlesungszeiten Donnerstag 09:15 - 12:00, Blockkurs (Frühlingssemester)
    Donnerstag 10:15 - 12:00, Blockkurs (Frühlingssemester)

    Unterricht

    Verantwortliche
    • Falquet Laurent
    Dozenten-innen
    • Falquet Laurent
    Beschreibung

    Students will learn the basic principles of metagenomics data analysis and their associated methods. The course will cover the targeted methods (16S, ITS) as well as the Whole Genome/Transcriptome Sequencing methods, both in prokaryotes and eukaryotes. Students will learn which kind of data could be extracted from metagenomics analysis and how to analyze and represent these data.
    Zugangsbedingungen

    Prerequisite: SBC.07106 or SBC.07110
    Soft Skills Nein
    ausserhalb des Bereichs Nein
    BeNeFri Nein
    Mobilität Nein
    UniPop Nein
  • Einzeltermine und Räume
    Datum Zeit Art der Unterrichtseinheit Ort
    09.03.2023 09:15 - 12:00 Kurs PER 21, Raum F207
    16.03.2023 09:15 - 12:00 Kurs PER 21, Raum F207
    23.03.2023 09:15 - 12:00 Kurs PER 21, Raum F207
    30.03.2023 09:15 - 12:00 Kurs PER 21, Raum F207
    06.04.2023 10:15 - 12:00 Kurs PER 21, Raum B207
  • Leistungskontrolle

    Schriftliche Prüfung - FS-2023, Sommersession 2023

    Datum 20.06.2023 15:00 - 16:00
    Bewertungsmodus Nach Note
    Beschreibung

    Written exam (60 min.). One mark. 

    Schriftliche Prüfung - FS-2023, Herbstsession 2023

    Datum 08.09.2023 10:00 - 11:00
    Bewertungsmodus Nach Note
    Beschreibung

    Written exam (60 min.). One mark. 
  • Zuordnung
    Zählt für die folgenden Studienpläne:
    Bioinformatik [3e cycle]
    Version: 2024_2/V_01
    Weiterbildung > UE für Vertiefungsstudium in Biologie (Niveau Master)

    Biologie [3e cycle]
    Version: 2024_2/V_01
    Weiterbildung > UE für Vertiefungsstudium in Biologie (Niveau Master)

    Biologie [POST-DOC]
    Version: 2015_1/V_01
    Weiterbildung > UE für Vertiefungsstudium in Biologie (Niveau Master)

    Ergänzende Lehrveranstaltungen in Naturwissenschaften
    Version: ens_compl_sciences
    Paquet indépendant des branches > UE für Vertiefungsstudium in Biologie (Niveau Master)

    MSc in Bioinformatik und computationale Biologie [MA] 120
    Version: 2024_1/V_01
    MSc in Bioinformatik und computationale Biologie, Vorlesungen > MSc-BI, Module “Genomics” (ab HS2020)
    MSc in Umweltbiologie, Option Angewandte Umweltbiologie 120 [MA]
    Version: 2024_1/V_01
    MSc in Umweltbiologie, Option Angewandte Umweltbiologie, Vorlesungen und Seminare (ab HS2021) > MSc-EB, Option Angewandte Umweltbiologie, UE zur Wahl (ab HS2024) > Empfohlene Kurse
    MSc in Umweltbiologie, Option Pflanzen- und Mikrobiologie 120 [MA]
    Version: 2024_1/V_01
    MSc in Umweltbiologie, Option Pflanzen- und Mikrobiologie, Vorlesungen und Seminare (ab HS2021) > MSc-EB, Option Pflanzen- und Mikrobiologie, UE zur Wahl (ab HS2024) > Empfohlene Kurse
    MSc in Umweltbiologie, Option Unterricht 90 [MA]
    Version: 2024_1/V_01
    MSc in Umweltbiologie, Option Unterricht, Vorlesungen und Seminare (ab HS2021) > MSc-EB, Option Unterricht, UE zur Wahl (ab HS2024) > Optionale Kurse
    MSc in Umweltbiologie, Option Ökologie und Evolution 120 [MA]
    Version: 2024_1/V_01
    MSc in Umweltbiologie, Option Ökologie und Evolution, Vorlesungen und Seminare (ab HS2021) > MSc-EB, Option Ökologie und Evolution, UE zur Wahl (ab HS2024) > Optionale Kurse
    MSc in molekularer Lebens- und Gesundheitswissenschaften, Option Biochemie und Zellbiologie 120 [MA]
    Version: 2024_1/V_01
    MSc in molekularer Lebens- und Gesundheitswissenschaften, Option Biochemie und Zellbiologie, Vorlesungen und Seminare (ab HS2021) > MSc-ML, Option Biochemie und Zellbiologie, UE zur Wahl (ab HS2024) > Empfohlene Kurse
    MSc in molekularer Lebens- und Gesundheitswissenschaften, Option Entwicklungsbiologie und Regeneration 120 [MA]
    Version: 2024_1/V_01
    MSc in molekularer Lebens- und Gesundheitswissenschaften, Option Entwicklungsbiologie und Regeneration, Vorlesungen und Seminare (ab HS2021) > MSc-ML, Option Entwicklungsbiologie und Regeneration, UE zur Wahl (ab HS2024) > Optionale Kurse
    MSc in molekularer Lebens- und Gesundheitswissenschaften, Option Meeresbiologie 120 [MA]
    Version: 2024_1/V_01
    MSc in molekularer Lebens- und Gesundheitswissenschaften, Option Meeresbiologie, Vorlesungen und Seminare (ab HS2021) > MSc-ML, Option Meeresbiologie, UE zur Wahl (ab HS2024) > Optionale Kurse
    MSc in molekularer Lebens- und Gesundheitswissenschaften, Option Neurobiologie 120 [MA]
    Version: 2024_1/V_01
    MSc in molekularer Lebens- und Gesundheitswissenschaften, Option Neurobiologie, Vorlesungen und Seminare (ab HS2021) > MSc-ML, Option Neurobiologie, UE zur Wahl (ab HS2024) > Optionale Kurse
    MSc in molekularer Lebens- und Gesundheitswissenschaften, Option Unterricht 90 [MA]
    Version: 2024_1/V_01
    MSc in molekularer Lebens- und Gesundheitswissenschaften, Option Unterricht, Vorlesungen und Seminare (ab HS2021) > MSc-ML, Option Unterricht, UE zur Wahl (ab HS2024) > Optionale Kurse
    Zusatz zum Doktorat [PRE-DOC]
    Version: 2020_1/v_01
    Zusatz zum Doktorat (Math.-Nat. und Med. Fakultät) > UE für Vertiefungsstudium in Biologie (Niveau Master)