Bioinformatics (practical course, in silico)

  • Unterricht

    Details

    Fakultät Math.-Nat. und Med. Fakultät
    Bereich Biochemie
    Code UE-SBC.07107
    Sprachen Englisch
    Art der Unterrichtseinheit Praktische Arbeit
    Kursus Master
    Semester SA-2022

    Zeitplan und Räume

    Vorlesungszeiten Montag , Blockkurs (Herbstsemester)
    Strukturpläne 2 jours par semaine sur 3 semaines
    Kontaktstunden
    		42

    Unterricht

    Verantwortliche
    • Falquet Laurent
    Dozenten-innen
    • Falquet Laurent
    Lernziele

    Learn to handle large NGS datasets of sequences using Unix HPC for various analyses: e.g. remapping, genome assembly, RNAseq,...
    Bemerkungen

    The SBC.07110 course is a compulsory prerequisite to take the SBC.07107 course.

    Please bring your own laptop for this course
    Soft Skills Nein
    ausserhalb des Bereichs Nein
    BeNeFri Ja
    Mobilität Ja
    UniPop Nein
  • Einzeltermine und Räume
    Datum Zeit Art der Unterrichtseinheit Ort
    07.11.2022 09:15 - 17:00 Kurs PER 17, Raum 001
    09.11.2022 09:15 - 17:00 Kurs PER 17, Raum 001
    14.11.2022 09:15 - 17:00 Kurs PER 17, Raum 001
    16.11.2022 09:15 - 17:00 Kurs PER 17, Raum 001
    21.11.2022 09:15 - 17:00 Kurs PER 17, Raum 001
    23.11.2022 09:15 - 17:00 Kurs PER 17, Raum 001
  • Leistungskontrolle

    Schriftliche Arbeit und Vortrag

    Bewertungsmodus Nach Note
    Beschreibung

    Written report and oral presentation during the semester. One mark.

    Mündliche Prüfung - SP-2023, Herbstsession 2023

    Bewertungsmodus Nach Note
    Beschreibung

    Written report and oral presentation or written exam of 60 minutes. One mark is given.

    Session d'examens automne 2023: examen oral 20 min. Une note. Changement de modalité. 
  • Zuordnung
    Zählt für die folgenden Studienpläne:
    Biochemie [3e cycle]
    Version: 2015_1/V_01
    Weiterbildung > UE für Vertiefungsstudium in Biochemie (Niveau Master)

    Biochemie [POST-DOC]
    Version: 2015_1/V_01
    Weiterbildung > UE für Vertiefungsstudium in Biochemie (Niveau Master)

    Ergänzende Lehrveranstaltungen in Naturwissenschaften
    Version: ens_compl_sciences
    Paquet indépendant des branches > UE für Vertiefungsstudium in Biochemie (Niveau Master)

    MSc in Bioinformatik und computationale Biologie [MA] 120
    Version: 2023_1/V_01
    MSc in Bioinformatik und computationale Biologie, Vorlesungen > MSc-BI, Module “Genomics” (ab HS2020)
    MSc in Umweltbiologie, Option Angewandte Umweltbiologie 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc in Umweltbiologie, Option Angewandte Umweltbiologie, Vorlesungen und Seminare (ab HS2021) > MSc-EB, Option Angewandte Umweltbiologie, UE zur Wahl (ab HS2022) > Empfohlene Kurse
    MSc in Umweltbiologie, Option Pflanzen- und Mikrobiologie 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc in Umweltbiologie, Option Pflanzen- und Mikrobiologie, Vorlesungen und Seminare (ab HS2021) > MSc-EB, Option Pflanzen- und Mikrobiologie, UE zur Wahl (ab HS2022) > Empfohlene Kurse
    MSc in Umweltbiologie, Option Unterricht 90 [MA]
    Version: 2023_1/V_01
    MSc in Umweltbiologie, Option Unterricht, Vorlesungen und Seminare (ab HS2021) > MSc-EB, Option Unterricht, UE zur Wahl (ab HS2023) > Optionale Kurse
    MSc in Umweltbiologie, Option Ökologie und Evolution 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc in Umweltbiologie, Option Ökologie und Evolution, Vorlesungen und Seminare (ab HS2021) > MSc-EB, Option Ökologie und Evolution, UE zur Wahl (ab HS2022) > Empfohlene Kurse
    MSc in molekularer Lebens- und Gesundheitswissenschaften, Option Biochemie und Zellbiologie 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc in molekularer Lebens- und Gesundheitswissenschaften, Option Biochemie und Zellbiologie, Vorlesungen und Seminare (ab HS2021) > MSc-ML, Option Biochemie und Zellbiologie, UE zur Wahl (ab HS2021) > Empfohlene Kurse
    MSc in molekularer Lebens- und Gesundheitswissenschaften, Option Entwicklungsbiologie und Regeneration 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc in molekularer Lebens- und Gesundheitswissenschaften, Option Entwicklungsbiologie und Regeneration, Vorlesungen und Seminare (ab HS2021) > MSc-ML, Option Entwicklungsbiologie und Regeneration, UE zur Wahl (ab HS2021) > Optionale Kurse
    MSc in molekularer Lebens- und Gesundheitswissenschaften, Option Meeresbiologie 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc in molekularer Lebens- und Gesundheitswissenschaften, Option Meeresbiologie, Vorlesungen und Seminare (ab HS2021) > MSc-ML, Option Meeresbiologie, UE zur Wahl (ab HS2021) > Empfohlene Kurse
    MSc in molekularer Lebens- und Gesundheitswissenschaften, Option Neurobiologie 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc in molekularer Lebens- und Gesundheitswissenschaften, Option Neurobiologie, Vorlesungen und Seminare (ab HS2021) > MSc-ML, Option Neurobiologie, UE zur Wahl (ab HS2021) > Optionale Kurse
    MSc in molekularer Lebens- und Gesundheitswissenschaften, Option Unterricht 90 [MA]
    Version: 2023_1/V_01
    MSc in molekularer Lebens- und Gesundheitswissenschaften, Option Unterricht, Vorlesungen und Seminare (ab HS2021) > MSc-ML, Option Unterricht, UE zur Wahl (ab HS2023) > Optionale Kurse
    Zusatz zum Doktorat [PRE-DOC]
    Version: 2020_1/v_01
    Zusatz zum Doktorat (Math.-Nat. und Med. Fakultät) > UE für Vertiefungsstudium in Biochemie (Niveau Master)