Classical models in biology (lecture)

  • Unterricht

    Details

    Fakultät Math.-Nat. und Med. Fakultät
    Bereich Biologie
    Code UE-SBL.06002
    Sprachen Englisch
    Art der Unterrichtseinheit Vorlesung
    Kursus Master
    Semester SP-2019

    Zeitplan und Räume

    Kontaktstunden 28

    Unterricht

    Verantwortliche
    • Bersier Louis-Félix
    Dozenten-innen
    • Bersier Louis-Félix
    • Rohr Rudolf Philippe
    Beschreibung Le cours commence par une analyse approfondie des modèles classiques en dynamique des populations. Ensuite, le modèle de Bernoulli pour la variole est abordé mathématiquement; il est complété par les modèles épidémiologiques simples. La mathématique des modèles du chémostat, des populations avec structure d'âge et de Luria-Delbrück est expliquée. Le cours finit par l'analyse de divers modèles décrivant les interactions entre espèces. Le cours introduit les concepts d'équations différentielles et aux différences finies, d'équilibre, de stabilité, d'espace de phase, de stabilité locale, de valeurs et vecteurs propres, et de modèles déterministes et stochastiques.

    The course starts with an in-depth analysis of classical models of population dynamics. It continues with the mathematical treatment of Bernoulli model of smallpox disease, and extends to epidemiological models. The mathematics of chemostat, age-structured, and Luria-Delbrück models are explained. The course ends with study of various models for systems of interacting species. The course introduces the concepts of differential and finite difference equations, equilibrium, stability, phase space, local stability analysis, eigenvalues and eigenvectors, and deterministic and stochastic models.
    Lernziele Les étudiants seront capables de comprendre d'une manière critique les modèles classiques en biologie. Ils sauront lire et analyser les équations et évaluer leurs hypothèses de base, leurs porté et limitations. Ils auront acquis les connaissances nécessaires pour élaborer des modèles simples et pour communiquer avec les mathématiciens lors du développement de modèles plus complexes.

    Students will be able to critacally understand classical models in biology. They will be able to read and analyze equations, and to evaluate their assumptions, scope and limitations. They will acquire the necessary skills to elaborate simple models and to communicate and interact with mathematicians in the development of more complex models.
    Bemerkungen Remplace MA.6002
    Soft Skills Nein
    ausserhalb des Bereichs Nein
    BeNeFri Ja
    Mobilität Ja
    UniPop Nein
  • Leistungskontrolle

    Schriftliche Prüfung - SP-2019, Sommersession 2019

    Bewertungsmodus Nach Note
    Beschreibung Written (45 min.) or oral (20 min.) exam

    Schriftliche Prüfung - SP-2019, Herbstsession 2019

    Bewertungsmodus Nach Note
    Beschreibung Written (45 min.) or oral (20 min.) exam
  • Zuordnung
    Zählt für die folgenden Studienpläne:
    Biologie [3e cycle]
    Version: 2015_1/V_01
    Weiterbildung > UE für Vertiefungsstudium in Biologie (Niveau Master)

    Biologie [POST-DOC]
    Version: 2015_1/V_01
    Weiterbildung > UE für Vertiefungsstudium in Biologie (Niveau Master)

    Ergänzende Lehrveranstaltungen in Naturwissenschaften
    Version: ens_compl_sciences
    Paquet indépendant des branches > UE für Vertiefungsstudium in Biologie (Niveau Master)

    MSc in Bioinformatik und computationale Biologie [MA] 120
    Version: 2023_1/V_01
    MSc in Bioinformatik und computationale Biologie, Vorlesungen > MSc-BI, Module “Bioinformatic Applications” (ab HS2020)

    MSc in Umwelt- und Umweltgeisteswissenschaften [MA] 120
    Version: 2023_1/V_01
    MSc in Umwelt- und Umweltgeisteswissenschaften, obligatorischen UE > MSc-SE, Environmental Biology Module (ab HS2022)

    MSc in Umweltbiologie, Option Angewandte Umweltbiologie 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc in Umweltbiologie, Option Angewandte Umweltbiologie, Vorlesungen und Seminare (ab HS2021) > MSc-EB, Option Angewandte Umweltbiologie, UE zur Wahl (ab HS2022) > Empfohlene Kurse

    MSc in Umweltbiologie, Option Pflanzen- und Mikrobiologie 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc in Umweltbiologie, Option Pflanzen- und Mikrobiologie, Vorlesungen und Seminare (ab HS2021) > MSc-EB, Option Pflanzen- und Mikrobiologie, UE zur Wahl (ab HS2022) > Empfohlene Kurse

    MSc in Umweltbiologie, Option Unterricht 90 [MA]
    Version: 2023_1/V_01
    MSc in Umweltbiologie, Option Unterricht, Vorlesungen und Seminare (ab HS2021) > MSc-EB, Option Unterricht, UE zur Wahl (ab HS2023) > Empfohlene Kurse

    MSc in Umweltbiologie, Option Ökologie und Evolution 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc in Umweltbiologie, Option Ökologie und Evolution, Vorlesungen und Seminare (ab HS2021) > MSc-EB, Option Ökologie und Evolution, obligatorischen UE (ab HS2022)

    Zusatz zum Doktorat [PRE-DOC]
    Version: 2020_1/v_01
    Zusatz zum Doktorat (Math.-Nat. und Med. Fakultät) > UE für Vertiefungsstudium in Biologie (Niveau Master)