Organization and annotation of eukaryote genomes

  • Unterricht

    Details

    Fakultät Math.-Nat. und Med. Fakultät
    Bereich Biologie
    Code UE-SBL.30004
    Sprachen Englisch
    Art der Unterrichtseinheit Blockkurs
    Kursus Master
    Semester SA-2021

    Titel

    Französisch Organisation et annotation des génomes eukaryotiques
    Deutsch Organisation und Annotation von eukaryotischen Genomen
    Englisch Organization and annotation of eukaryote genomes

    Zeitplan und Räume

    Vorlesungszeiten Mittwoch , Blockkurs (Herbstsemester)
    Strukturpläne cours bloc
    Kontaktstunden 48

    Unterricht

    Verantwortliche
    • Parisod Christian
    Dozenten-innen
    • Parisod Christian
    Beschreibung

    (SBL.30004; 3 ECTS; lecture with exercises) This course examines the main evolutionary processes shaping the organization plant and animal genomes. It compares and operates complementary approaches to characterize gene models as well as transposable element in model and non-model organisms. Using adequate tools to identify duplicated sequences and ‘junk DNA’, it will also address how to benefit from genomic variation. A mix of lectures and practical exercises will enable students to take advantage of current approaches to robustly describe and understand Eukaryote genomes.

    Soft Skills Nein
    ausserhalb des Bereichs Ja
    BeNeFri Ja
    Mobilität Ja
    UniPop Nein
  • Einzeltermine und Räume
    Datum Zeit Art der Unterrichtseinheit Ort
    20.10.2021 08:15 - 17:00 Kurs VIL 01, Raum STP
    27.10.2021 08:15 - 17:00 Kurs VIL 01, Raum STP
    03.11.2021 08:15 - 17:00 Kurs VIL 01, Raum STP
    10.11.2021 08:15 - 17:00 Kurs VIL 01, Raum STP
    17.11.2021 08:15 - 17:00 Kurs VIL 01, Raum STP
    24.11.2021 08:15 - 11:00 Kurs PER 04, Raum 0.110
    24.11.2021 13:15 - 17:00 Kurs PER 04, Raum 0.109
  • Leistungskontrolle

    Bericht

    Bewertungsmodus Nach Note
    Beschreibung

    Written exam (90 min.). One mark

    Modification of the evaluation modality (SA2021): report. One mark. 

  • Zuordnung
    Zählt für die folgenden Studienpläne:
    Biologie [3e cycle]
    Version: 2015_1/V_01
    Weiterbildung > UE für Vertiefungsstudium in Biologie (Niveau Master)

    Biologie [POST-DOC]
    Version: 2015_1/V_01
    Weiterbildung > UE für Vertiefungsstudium in Biologie (Niveau Master)

    Ergänzende Lehrveranstaltungen in Naturwissenschaften
    Version: ens_compl_sciences
    Paquet indépendant des branches > UE für Vertiefungsstudium in Biologie (Niveau Master)

    MSc in Bioinformatik und computationale Biologie [MA] 120
    Version: 2023_1/V_01
    MSc in Bioinformatik und computationale Biologie, Vorlesungen > MSc-BI, Module “Genomics” (ab HS2020)

    MSc in Umweltbiologie, Option Angewandte Umweltbiologie 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc in Umweltbiologie, Option Angewandte Umweltbiologie, Vorlesungen und Seminare (ab HS2021) > MSc-EB, Option Angewandte Umweltbiologie, UE zur Wahl (ab HS2022) > Optionale Kurse

    MSc in Umweltbiologie, Option Pflanzen- und Mikrobiologie 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc in Umweltbiologie, Option Pflanzen- und Mikrobiologie, Vorlesungen und Seminare (ab HS2021) > MSc-EB, Option Pflanzen- und Mikrobiologie, UE zur Wahl (ab HS2022) > Optionale Kurse

    MSc in Umweltbiologie, Option Unterricht 90 [MA]
    Version: 2023_1/V_01
    MSc in Umweltbiologie, Option Unterricht, Vorlesungen und Seminare (ab HS2021) > MSc-EB, Option Unterricht, UE zur Wahl (ab HS2023) > Optionale Kurse

    MSc in Umweltbiologie, Option Ökologie und Evolution 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc in Umweltbiologie, Option Ökologie und Evolution, Vorlesungen und Seminare (ab HS2021) > MSc-EB, Option Ökologie und Evolution, UE zur Wahl (ab HS2022) > Empfohlene Kurse

    MSc in molekularer Lebens- und Gesundheitswissenschaften, Option Biochemie und Zellbiologie 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc in molekularer Lebens- und Gesundheitswissenschaften, Option Biochemie und Zellbiologie, Vorlesungen und Seminare (ab HS2021) > MSc-ML, Option Biochemie und Zellbiologie, UE zur Wahl (ab HS2021) > Optionale Kurse

    MSc in molekularer Lebens- und Gesundheitswissenschaften, Option Entwicklungsbiologie und Regeneration 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc in molekularer Lebens- und Gesundheitswissenschaften, Option Entwicklungsbiologie und Regeneration, Vorlesungen und Seminare (ab HS2021) > MSc-ML, Option Entwicklungsbiologie und Regeneration, UE zur Wahl (ab HS2021) > Optionale Kurse

    MSc in molekularer Lebens- und Gesundheitswissenschaften, Option Meeresbiologie 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc in molekularer Lebens- und Gesundheitswissenschaften, Option Meeresbiologie, Vorlesungen und Seminare (ab HS2021) > MSc-ML, Option Meeresbiologie, UE zur Wahl (ab HS2021) > Optionale Kurse

    MSc in molekularer Lebens- und Gesundheitswissenschaften, Option Neurobiologie 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc in molekularer Lebens- und Gesundheitswissenschaften, Option Neurobiologie, Vorlesungen und Seminare (ab HS2021) > MSc-ML, Option Neurobiologie, UE zur Wahl (ab HS2021) > Optionale Kurse

    MSc in molekularer Lebens- und Gesundheitswissenschaften, Option Unterricht 90 [MA]
    Version: 2023_1/V_01
    MSc in molekularer Lebens- und Gesundheitswissenschaften, Option Unterricht, Vorlesungen und Seminare (ab HS2021) > MSc-ML, Option Unterricht, UE zur Wahl (ab HS2023) > Optionale Kurse

    Zusatz zum Doktorat [PRE-DOC]
    Version: 2020_1/v_01
    Zusatz zum Doktorat (Math.-Nat. und Med. Fakultät) > UE für Vertiefungsstudium in Biologie (Niveau Master)