Bioinformatics (practical course, in silico)

  • Enseignement

    Détails

    Faculté Faculté des sciences et de médecine
    Domaine Biochimie
    Code UE-SBC.07107
    Langues Anglais
    Type d'enseignement Travail pratique
    Cursus Master
    Semestre(s) SA-2020

    Horaires et salles

    Horaire résumé Lundi , Cours bloc (Semestre d'automne)
    Struct. des horaires 2 jours par semaine sur 3 semaines
    Heures de contact
    		42

    Enseignement

    Responsables
    • Falquet Laurent
    Enseignants
    • Falquet Laurent
    Objectifs de formation

    Learn to handle large NGS datasets of sequences using Unix HPC for various analyses: e.g. remapping, genome assembly, RNAseq,...
    Commentaire

    The SBC.07110 course is a compulsory prerequisite to take the SBC.07107 course.

    Please bring your own laptop for this course
    Softskills Non
    Hors domaine Non
    BeNeFri Oui
    Mobilité Oui
    UniPop Non
  • Dates et salles
    Date Heure Type d'enseignement Lieu
    02.11.2020 09:15 - 17:00 Cours PER 17, salle 001
    04.11.2020 09:15 - 13:00 Cours PER 21, salle C130
    04.11.2020 13:15 - 17:00 Cours PER 17, salle 001
    09.11.2020 09:15 - 17:00 Cours PER 17, salle 001
    11.11.2020 09:15 - 13:00 Cours PER 21, salle C130
    11.11.2020 13:15 - 17:00 Cours PER 17, salle 001
    16.11.2020 09:15 - 17:00 Cours PER 17, salle 001
    18.11.2020 09:15 - 13:00 Cours PER 21, salle C130
    18.11.2020 13:15 - 17:00 Cours PER 17, salle 001
  • Modalités d'évaluation

    Examen oral - SA-2020, Session d'hiver 2021

    Date 18.02.2021 09:00 - 10:00
    Mode d'évaluation Par note
    Description

    Ancienne modalité: "Written report and oral presentation" (noté sur 6)

    Vu COVID-19:

    Nouvelle modalité: Oral exam (20 min), one mark
    Commentaire

    COVID-19 - Modalité d'évaluation: Épreuve écrite en ligne de 60 min. Une note. 

    Examen oral - SP-2021, Session d'automne 2021

    Date 07.09.2021 09:00 - 09:20
    Mode d'évaluation Par note
    Description

    Ancienne modalité: "Written report and oral presentation" (noté sur 6)

    Vu COVID-19:

    Nouvelle modalité: Oral exam (20 min), one mark
    Commentaire

    Oral exam in presence (20 min), one mark
  • Affiliation
    Valable pour les plans d'études suivants:
    Biochimie [3e cycle]
    Version: 2015_1/V_01
    Formation continue > UE de spécialisation en Biochimie (niveau master)
    Biochimie [POST-DOC]
    Version: 2015_1/V_01
    Formation continue > UE de spécialisation en Biochimie (niveau master)
    Complément au doctorat [PRE-DOC]
    Version: 2020_1/v_01
    Complément au doctorat ( Faculté des sciences et de médecine) > UE de spécialisation en Biochimie (niveau master)
    Enseignement complémentaire en sciences
    Version: ens_compl_sciences
    Paquet indépendant des branches > UE de spécialisation en Biochimie (niveau master)
    MSc en Sciences moléculaires du vivant et de la santé, option Biochimie et biologie cellulaire 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc en Sciences moléculaires du vivant et de la santé, option Biochimie et biologie cellulaire, cours et séminaires (dès SA2021) > MSc-ML, option Biochimie et biologie cellulaire, UE à choix (dès SA2021) > Cours recommandés
    MSc en Sciences moléculaires du vivant et de la santé, option Biologie du développement et régénération 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc en Sciences moléculaires du vivant et de la santé, option Biologie du développement et régénération, cours et séminaires (dès SA2021) > MSc-ML, option Biologie du développement et régénération, UE à choix (dès SA2021) > Cours optionnels
    MSc en Sciences moléculaires du vivant et de la santé, option Biologie marine 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc en Sciences moléculaires du vivant et de la santé, option Biologie marine, cours et séminaires (dès SA2021) > MSc-ML, option Biologie marine, UE à choix (dès SA2021) > Cours recommandés
    MSc en Sciences moléculaires du vivant et de la santé, option Enseignement 90 [MA]
    Version: 2023_1/V_01
    MSc en Sciences moléculaires du vivant et de la santé, option Enseignement, cours et séminaires (dès SA2021) > MSc-ML, option Enseignement, UE à choix (dès SA2023) > Cours optionnels
    MSc en Sciences moléculaires du vivant et de la santé, option Neurobiologie 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc en Sciences moléculaires du vivant et de la santé, option Neurobiologie, cours et séminaires (dès SA2021) > MSc-ML, option Neurobiologie, UE à choix (dès SA2021) > Cours optionnels
    MSc en bioinformatique et biologie computationnelle [MA] 120
    Version: 2023_1/V_01
    MSc en bioinformatique et biologie computationnelle, cours > MSc-BI, Module “Genomics” (dès SA2020)
    MSc en biologie de l’environnement, option Biologie environnementale appliquée 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc en biologie de l’environnement, option Biologie environnementale appliquée, cours et séminaires (dès SA2021) > MSc-EB, option Biologie environnementale appliquée, UE à choix (dès SA2022) > Cours recommandés
    MSc en biologie de l’environnement, option Enseignement 90 [MA]
    Version: 2023_1/V_01
    MSc en biologie de l’environnement, option Enseignement, cours et séminaires (dès SA2021) > MSc-EB, option Enseignement, UE à choix (dès SA2023) > Cours optionnels
    MSc en biologie de l’environnement, option Sciences végétales et microbiennes 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc en biologie de l’environnement, option Sciences végétales et microbiennes, cours et séminaires (dès SA2021) > MSc-EB, option Sciences végétales et microbiennes, UE à choix (dès SA2022) > Cours recommandés
    MSc en biologie de l’environnement, option Écologie et évolution 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc en biologie de l’environnement, option Écologie et évolution, cours et séminaires (dès SA2021) > MSc-EB, option Écologie et évolution, UE à choix (dès SA2022) > Cours recommandés