Détails

Faculté	Faculté des sciences et de médecine
Domaine	Biochimie
Code	UE-SBC.07005
Langues	Anglais
Type d'enseignement	Cours Exercice
Cursus	Bachelor
Semestre(s)	SA-2022

Titre

Français	Bioinformatique et génomique avancées
Allemand	Fortgeschrittene Bioinformatik und Genomik
Anglais	Advanced bioinformatics and genomics

Horaires et salles

Horaire résumé	Vendredi , Cours bloc (Semestre d'automne)
Struct. des horaires	weekly lecture 16 hours + exercises 16 hours
Heures de contact	32

Enseignement

Responsables	Falquet Laurent
Enseignants	Falquet Laurent
Description	Ce cours est une suite directe du cours de base SBC.07004. Il approfondit les méthodes d'application du séquençage de nouvelle génération, comme l'assemblage et l'annotation de novo du génome et du transcriptome, le remappage et l'identification des variants, la transcriptomique, ChIPseq et les méthodes similaires, l'épigénomique, le microbiome et la métagénomique, la génomique des populations.   Chaque semaine, un concept principal est détaillé, expliquant les algorithmes des méthodes les plus importantes avec un regard particulier sur leurs avantages et inconvénients. Chaque semaine, des exercices pratiques directement liés aux cours théoriques sont utilisés pour renforcer l'apprentissage en s'appuyant sur des outils web simples lorsque cela est possible.
Commentaire	Prérequis: SBC.07004 Attention: ne peut pas être pris conjointement à SBC.07003 La présence aux sessions d'exercices est recommandée.
Softskills	Non
Hors domaine	Oui
BeNeFri	Oui
Mobilité	Oui
UniPop	Non

Examen écrit - SA-2022, Session d'hiver 2023

Date	16.02.2023 08:15 - 08:45
Mode d'évaluation	Par note
Description	Epreuve écrite (30 minutes). Une note est attribuée.