Advanced bioinformatics and genomics

  • Unterricht

    Details

    Fakultät Math.-Nat. und Med. Fakultät
    Bereich Biochemie
    Code UE-SBC.07005
    Sprachen Englisch
    Art der Unterrichtseinheit Vorlesung
    Übung
    Kursus Bachelor
    Semester SA-2022

    Titel

    Französisch Bioinformatique et génomique avancées
    Deutsch Fortgeschrittene Bioinformatik und Genomik
    Englisch Advanced bioinformatics and genomics

    Zeitplan und Räume

    Vorlesungszeiten Freitag , Blockkurs (Herbstsemester)
    Strukturpläne weekly lecture 16 hours + exercises 16 hours
    Kontaktstunden 32

    Unterricht

    Verantwortliche
    • Falquet Laurent
    Dozenten-innen
    • Falquet Laurent
    Beschreibung

    Dieser Kurs ist eine direkte Fortsetzung des Grundkurses SBC.07004. Er vertieft die Methoden der Next Generation Sequencing-Anwendungen, wie de novo Genom- und Transkriptom-Assembly & Annotation, Remapping & Variantenidentifikation, Transkriptomik, ChIPseq & verwandte Methoden, Epigenomik, Mikrobiom & Metagenomik, Populationsgenomik.

     

    Jede Woche wird ein Hauptkonzept detailliert behandelt, wobei die Algorithmen der wichtigsten Methoden mit einem besonderen Blick auf ihre Vor- und Nachteile erklärt werden. Jede Woche werden praktische Übungen, die direkt mit den theoretischen Vorlesungen verbunden sind, verwendet, um das Lernen zu verstärken, wobei, wann immer möglich, auf einfache Web-Tools zurückgegriffen wird.

     

     

    Bemerkungen

    Prérequis: SBC.07004
    Attention: ne peut pas être pris conjointement à SBC.07003

    La présence aux sessions d'exercices est recommandée.

    Soft Skills Nein
    ausserhalb des Bereichs Ja
    BeNeFri Ja
    Mobilität Ja
    UniPop Nein
  • Einzeltermine und Räume
    Datum Zeit Art der Unterrichtseinheit Ort
    04.11.2022 13:15 - 15:00 Kurs PER 21, Raum E140
    08.11.2022 10:15 - 12:00 Kurs PER 21, Raum C140
    11.11.2022 13:15 - 15:00 Kurs PER 21, Raum E140
    18.11.2022 13:15 - 15:00 Kurs PER 21, Raum E140
    22.11.2022 10:15 - 12:00 Kurs PER 21, Raum C140
    25.11.2022 13:15 - 15:00 Kurs PER 21, Raum E140
    29.11.2022 10:15 - 12:00 Kurs PER 21, Raum C140
    02.12.2022 13:15 - 15:00 Kurs PER 21, Raum E140
    06.12.2022 10:15 - 12:00 Kurs PER 21, Raum C140
    09.12.2022 13:15 - 15:00 Kurs PER 21, Raum E140
    13.12.2022 10:15 - 12:00 Kurs PER 21, Raum C140
    16.12.2022 13:15 - 15:00 Kurs PER 21, Raum E140
    23.12.2022 13:15 - 15:00 Kurs PER 21, Raum E140
  • Leistungskontrolle

    Schriftliche Prüfung - SA-2022, Wintersession 2023

    Datum 16.02.2023 08:15 - 08:45
    Bewertungsmodus Nach Note
    Beschreibung

    Epreuve écrite (30 minutes). Une note est attribuée.

  • Zuordnung
    Zählt für die folgenden Studienpläne:
    Biochemie 30
    Version: 2022_1/V_01
    Zusatzfach in Biochemie 30 > Biochemie, Zusatzfach BC-30, UE zur Wahl (ab HS2020)

    Biochemie 60
    Version: 2022_1/V_01
    Zusatzfach in Biochemie 60 > Biochemie, Zusatzfach BC-60, obligatorische UE (ab HS2021)

    Biochemie [3e cycle]
    Version: 2015_1/V_01
    Weiterbildung > Fortgeschrittene UE in Biochemie (Niveau Bachelor)

    Biochemie [POST-DOC]
    Version: 2015_1/V_01
    Weiterbildung > Fortgeschrittene UE in Biochemie (Niveau Bachelor)

    Biologie - von Genen zu Ökosystemen 30
    Version: 2022_1/V_01
    Zusatzfach in Biologie - von Genen zu Ökosystemen 30 > Biologie - von Genen zu Ökosystemen, Zusatzfach 30 ECTS, UE zur Wahl (ab 2022)

    Ergänzende Lehrveranstaltungen in Naturwissenschaften
    Version: ens_compl_sciences
    Paquet indépendant des branches > Fortgeschrittene UE in Biochemie (Niveau Bachelor)

    Medizinische und molekulare Biowissenschaften 30
    Version: 2022_1/V_01
    Zusatzfach in Medizinische und molekulare Biowissenschaften 30 > Medizinische und molekulare Biowissenschaften, Zusatzfach 30 ECTS, UE zur Wahl (ab 2022)

    Vorstufe zum MSc in Bioinformatik und computationale Biologie [PRE-MA]
    Version: 2022_1/V_01
    Vorstufe zum MSc in Bioinformtics and Computational Biology > Fortgeschrittene UE in Biochemie (Niveau Bachelor)

    Vorstufe zum MSc in Biology [PRE-MA]
    Version: 2022_1/V_01
    Vorstufe zum MSc in Biologie > Fortgeschrittene UE in Biochemie (Niveau Bachelor)

    Zusatz zum MSc in Bioinformatics and Computational Biology [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    Zusatz zum MSc in Bioinformatics and Computational Biology > Fortgeschrittene UE in Biochemie (Niveau Bachelor)

    Zusatz zum MSc in Biology [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    Zusatz zum MSc in Biologie > Fortgeschrittene UE in Biochemie (Niveau Bachelor)