Le Centre d'études pour la foi et la société fait partie de la Faculté de théologie de Fribourg, avec l'Institut d'études œcuméniques (ISO) et le Centre d’études des Églises d’Orient St-Nicolas. Le Centre d'études est relié à d'autres institutions et associations par le biais de diverses coopérations. Parmi les institutions associées au Centre d'études, par le biais d'accords ou d'une coopération régulière dans les domaines de la recherche, de l'enseignement et de la formation continue, on peut notamment citer les suivantes :