​La mission du Jardin Botanique de Fribourg est de sensibiliser le public au monde végétal et de contribuer ainsi à une prise de conscience de son importance et du rôle essentiel qu'il joue dans les écosystèmes de toute la planète et dans notre vie quotidienne.

• ​Assister l'enseignement et la recherche touchant au monde végétal à la faculté des sciences.
  
• Présenter, maintenir et améliorer des collections de plantes à thèmes variés dans un cadre attractif pour toucher un large public.
  
• Vulgariser et communiquer des connaissances sur les plantes et leur valeur pour la vie sur terre.
  
• Développer et promouvoir le rôle du JBF comme lieu d'échanges en matière de botanique et de conservation du monde végétal.
  
• Protéger et conserver la biodiversité de manière active et encourager tout ce qui se fait dans ce sens au niveau régional et national.